Producida en parte por el transporte desprotegido de residuos o de materiales industriales principalmente mineros, a lo largo de la ciudad. También por mal manejo de acopios, carga-descarga  de sustancias (carbón, plomo, etc.) en barrios industriales o puertos y por levantamiento de polvo en calles sin pavimento.

Deforestación de áreas verdes, falta de sombras urbanas y la construcción de islas de cemento, se generan por la deficiente planificación y gestión en la urbanización de la ciudad. Se agrega la congestión de estacionamientos en espacios residenciales mal planificados y la deficiente red de vías de transporte vehicular que afecta a algunas ciudades.

Problemas en la fiscalización y/o planes de manejo y protección de comunidades de plantas y animales silvestres (ecosistemas) de la zona terrestre y marino costera. Inexistencia o deficiencia de planes de conservación de especies con problemas de conservación terrestres y marinos.  Sobreexplotación de recursos pesqueros (mariscos y peces).

Aguas servidas de la ciudad no tienen un manejo y/o tratamiento adecuado, en cuanto a los efectos ambientales colaterales del funcionamiento de las plantas y sistemas de recolección y transporte (gases, olores, proliferación de insectos, vertimientos accidentales frecuentes). La disposición final del porcentaje de aguas servidas con tratamiento incompleto (solo primario o ninguno) genera problemas sanitarios y efectos negativos sobre los ecosistemas donde son vertidas.

Microbasurales ilegales (plásticos, vidrios, llantas, residuos de construcción, orgánicos, farmacéuticos, de procesos industriales), provocan daños a animales, vegetación y seres humanos. Se detectan en sectores peri-urbanos principalmente y algunos en áreas rurales. Son focos de infecciones, efectos tóxicos y proliferación de animales plaga.

El aumento de perros en las calles y áreas silvestres es un problema de tenencia de mascotas. Un problema asociado a la presencia de animales abandonados es cuando se convierten en animales asilvestrados y atacan a la fauna de la zona y a las personas en las calles.

Legislación incompleta o inexistente genera innumerables problemas de ordenamiento, manejo, regulación y/o fiscalización de acciones o usos de recursos que generan efectos ambientales negativos (ej. explotación de acuíferos sin autorización e incapacidad de mantener catastro fiscalizable). La escasez de políticas de planificación a largo plazo afecta la vida en general.

Falta de regulación o fiscalización de operaciones o actividades como desplazamiento de buses, camiones, ferrocarril, vehículos motorizados con escape libre, negocios ruidosos incluyendo fiestas, pubs, casinos.  Todos ellos producen crecientes deterioros sicológicos y pérdida de calidad de vida.

Como región cuya mayor actividad industrial es la minería, posee un historial de problemas ambientales que generan impactos de diversos tipos. El problema que se ha tipificado aquí dice relación con la actividad de exploración y explotación de minerales, separándolos de aquellos producidos por la industria de servicios (generación de energía, mantención de equipamiento, plantas de suministro de agua, terminales marítimos). Se focaliza en los problemas en el territorio con actividad exploratoria y aquel con la propia actividad extractiva y plantas de procesos minerales.

Saturación de iluminación nocturna impacta en la calidad de los cielos de áreas claves de la Región. Presenta un obstáculo importante para el desarrollo de la astronomía y el astro turismo, así como efectos negativos en rutas nocturnas de aves marinas que nidifican al interior del desierto (Golondrinas de Mar).

Toxicidad de suelos debido a la acumulación de metales pesados, principalmente en áreas portuarias actuales o históricas, afectando directamente a la comunidad. Por ejemplo  contaminación por plomo y otros elementos o compuestos detectados en ciudades con actividad minera (acopios, puertos, faenas) y encontrados en suelos, edificaciones e infraestructura a lo largo de la comuna.

Acopios mineros o instalaciones industriales en sectores urbanos residenciales o recreacionales o de alto valor paisajístico (turístico). El crecimiento de las ciudades sin planificación ni regulaciones adecuadas, ha permitido la permanencia de sitios industriales en medio de áreas cuyos usos actuales generan serias incompatibilidades (ej. Industrias y planta recicladora de residuos en La Portada de Antofagasta, Plantas mineras en barrio residencial y recreacional de Taltal, industrias en borde costero central de Tocopilla, etc.).